Netzwerke
Die unten aufgeführte Software ist für akademische Nutzer und für Testzwecke frei verfügbar.
Bei einer geplanten kommerziellen Nutzung wenden Sie sich bitte an uns wegen eines Nutzungsvertrages.
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Programm |
Beschreibung |
| METATOOL 5.1Externer Link |
Programm zur Berechnung der Nullraummatrizen, Elementarmoden und anderen strukturellen Eigenschaften von biochemischen Reaktionsnetzwerken. Octave- und Matlabversion verfügbar. |
| Vorgängerversion 5.0Externer Link METATOOL 4.xExterner Link |
Programm zur Berechnung der Nullraummatrizen, Elementarmoden und anderen strukturellen Eigenschaften von biochemischen Reaktionsnetzwerken. Einzelplatzversion |
| BlockDiagExterner Link |
Programm zur Berechnung und Blockdiagonalisierung der Nullraummatrizen zu stöchiometrischen Matrizen von chemischen Reaktionsnetzwerken. |
| Externer LinkOptiModeExterner Link |
Programm zur Bestimmung von Elementarmoden mit der höchsten molaren Ausbeute für ein spezifisches Substrat-Produkt-Paar in der Ausgabedatei von METATOOL. |
| SeparatorExterner Link |
Programm zur Zerlegung von grossen biochemischen Netzwerken in kleinere Netzwerke. |
| Reducing the number of modesExterner Link |
Ein Programm zur Berechnung von Elementarmoden bei verschiedener Einteilung in externe und interne Metabolite und zur Berechnung der annähernden kleinsten Zahl von Modi. |
| NAD+ metabolismExterner Link |
Visualisierung von allen Elementarmoden mit Metatool 5.1. bei der Analyse des NAD+-Stoffwechselnetzwerks. Mehr Details dazu sind in der Publikation de Figueiredo et al. 2011 Externer Linkzu finden. |